Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms