Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsf9P41274 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms