Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms