Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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