Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rom1P32958 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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