Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RxraP28700 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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