Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa4P28311 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa4P28311 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms