Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms