Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms