Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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