Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou2f1P25425 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms