Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk11bP24788 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms