Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8P23463 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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