Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms