Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms