Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms