Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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