Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms