Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a1P19437 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a1P19437 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms