Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RargP18911 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RargP18911 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms