Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gata1P17679 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms