Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rb1P13405 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rb1P13405 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rb1P13405 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rb1P13405 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rb1P13405 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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