Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtcP11725 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtcP11725 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms