Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cxcl2P10889 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms