Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms