Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms