Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CopeO89079 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CopeO89079 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CopeO89079 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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