Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms