Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms