Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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