Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tnfrsf11aO35305 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tnfrsf11aO35305 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tnfrsf11aO35305 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tnfrsf11aO35305 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf11aO35305 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf11aO35305 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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