Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms