Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GclmO09172 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GclmO09172 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GclmO09172 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms