Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms