Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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