Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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