Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Abhd4-202ENSMUST00000180359 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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