Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8888J3QPX5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8888J3QPX5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8888J3QPX5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms