Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms