Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms