Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm5294J3QP53 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5294J3QP53 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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