Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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