Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm11236J3QMS7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm11236J3QMS7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm11236J3QMS7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm11236J3QMS7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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