Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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