Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arid4aF8VPQ2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms