Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8247F6VRJ8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms