Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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