Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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