Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29094F6Q785 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms