Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
ApobE9Q414 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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ApobE9Q414 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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